狗先天性和遗传性骨、关节和肌肉疾病
在子宫内感染病毒的动物可能出生时肌肉骨骼系统患病或变形。若母亲在怀孕的某些阶段吃有毒植物，异常也可能是先天性的。一些影响肌肉骨骼系统的遗传性疾病可能源于神经系统。
软骨发育不良
软骨发育不良是狗的一种遗传性骨骼疾病，其中四肢、躯干或头部的骨骼可能出现发育不良或畸形。据报道，贵宾犬和苏格兰梗犬会发生四肢的软骨发育不良。这种疾病同样会影响到阿拉斯加雪橇犬、巴塞特猎犬、腊肠犬、贵宾犬和苏格兰梗犬的躯干及头部。患有软骨发育不良的狗也可能伴随着红细胞缺乏症。在巴塞特猎犬、腊肠犬和北京犬中，这种疾病导致的身体特征是这些品种典型的一部分。
肌营养不良样肌病
肌营养不良样的肌病已在动物中有所描述，其中包括许多进行性的肌肉疾病例子。它们可能是遗传性的，并且与人类的各种类型的肌肉萎缩症类似。
狗中有几种类型的肌肉萎缩症。一种类似于人类杜氏肌营养不良症的类型见于美国的金毛寻回犬和欧洲的爱尔兰梗犬，雄性狗更易受到影响。症状包括肌肉无力、吞咽困难、步态僵直以及肌肉质量减少。这种疾病是由缺乏维持肌肉膜正常功能的关键蛋白质所引起的。一些受影响的狗还会伴有心脏肌肉疾病。
另一种类型的营养不良影响着北美、欧洲和澳大利亚的拉布拉多寻回犬。患有这种营养不良的狗会表现出僵直的步态，它们会在大约六个月大时开始抗拒运动并失去肌肉质量。欧洲的布维耶犬可能会患上另一种影响其吞咽能力的营养不良。
糖原贮积症
糖原贮积症涉及一种复杂的碳水化合物——糖原，它通常储存在肝脏和肌肉中。身体将它转化为葡萄糖作为能量源。患有糖原贮积病的动物可能会逐渐变得虚弱，直到无法从躺卧的位置起身。受影响的物种包括狗、猫、牛、绵羊、马、鹌鹑、大鼠和小鼠。特别是，拉普兰犬被报告有II型糖原贮积症。
髋关节发育不良
髋关节发育不良是一种常见的髋关节发育异常。股骨不能恰当地嵌入髋臼，最终导致关节炎。这种疾病的风险增加在许多大型犬种中是遗传的。
骨软骨病
骨软骨病最常见于大型和巨型犬种。它影响生命的早期阶段，此时狗的生长速度最快，未成熟的骨骼承受最大的压力。在这种情况下，未成熟的关节软骨可能会从骨头上剥离。这些剥离的软骨在关节腔内自由漂浮，引起炎症、软骨碎片，并进一步干扰正常的骨骼发育。它最常影响肩关节、肘关节、膝关节和跗关节，按频率递减顺序排列。
成骨不全
成骨不全是另一种遗传疾病，狗因此具有极其脆弱的骨骼和松弛的关节。长骨通常很细且外表层很薄。兽医通过寻找骨头上的骨赘迹象来诊断这种情况，这表明近期有骨折。患有成骨不全症的动物的眼睛白色部分也可能呈现出蓝色。
骨岩病
骨岩病是一种罕见的遗传性疾病，也在狗中发现。患有这种疾病的动物在足月前10至30天胎死腹中。它会导致下颌缩短、臼齿阻塞和长骨易骨折。头骨和长骨中的骨髓腔被海绵状的骨头代替，而不是正常的骨髓。由此导致的颅骨增厚会对大脑施加压力。
狗的其他先天性和遗传性肌肉骨骼疾病
在狗中还有其他几种先天性和遗传性肌肉骨骼疾病。狗可能出生时缺少脚部或者四肢缺少某些骨头。狗也可能天生脚趾开裂或缺失，这种情况被称为“龙虾爪”缺陷或缺趾综合症。额外的脚趾更为常见，并且在大白熊犬中也有观察到。最后，有些狗的脚趾可能会融合在一起。
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